Действия игры разворачиваются между двумя враждующими сторонами: корпорацией Omni-Tek и повстанцами Clans. Они сражаются за контроль над планетой и месторождениями нотума[1]. Нотум являющийся самым дорогим веществом в мире также служит топливом для нанороботов. Эти микроскопические роботы можно программировать на любые задачи, эффекты от этого схожи с магией, они могут нагревать и охлаждать предметы, вылечивать любые ранения, защищать от различных вредных воздействий и даже открыли возможность воскрешать погибших при помощи технологии клонирования, после того как была открыта т.н. «душа» - энергетическая составляющая человека, которую в момент смерти нанороботы переносят во вновь созданное тело.
Нанотехнологии также позволили создать генетически измененные расы, которые и проживают на Rubi-Ka: Solitus, Opifex, Nanomage, Atrox.
Сюжет игры в большей части можно определить как нанопанк.
